Steven W. Kembel

Membre régulier
Écologie, biologie évolutive et bioinformatique
Université du Québec à Montréal
Département des sciences biologiques
C.P. 8888 Succ. Centre-Ville
Montréal (Québec) H3C 3P8
Canada

(514) 987-3000 Poste 5855

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Personnel

Directions d'étudiants

Doctorats
Mathieu Landry
Mona Parizadeh
Maîtrises
Remi Maglione
Melbert Schwarz

Codirections

Doctorats
Joel Jameson
Maîtrises
Cédric Boué
Renaud McKinnon
Ancien personnel
Travis Dawson (Tech. 2015)

Étudiants diplômés
Dirigés
Isabelle Laforest-Lapointe (Ph.D. 2017)
Jessica Wallace (M.Sc. 2016)
FORMATION
  • Research associate, Institute of Ecology & Evolution, University of Oregon, 2009-2012
  • Postdoctoral fellow, Department of Integrative Biology, University of California, Berkeley, 2007-2008
  • Ph.D., Biological Sciences, University of Alberta, 2007
  • M.Sc., Biological Sciences, University of Alberta, 2001
  • B.Sc.(Hons.), Botany, University of Manitoba, 1997
THÈMES DE RECHERCHE

Mon programme de recherche se concentre sur

  • la compréhension des processus responsables de l'assemblage et l'évolution des communautés végétales et microbiennes
  • l'écologie fonctionnelle des feuilles et des racines des plantes
  • l'écologie des associations hôtes-microbes

Titulaire de la Chaire de recherche du Canada - Biodiversité et Interactions des plantes et de la vie microbienne.
Thématique : Beaucoup d’espèces microbiennes vivent sur les feuilles des plantes et jouent un rôle important dans la croissance et la fonction des plantes, ainsi que sur l’activité des écosystèmes forestiers. En regard de l'importance de la biodiversité pour la santé humaine et le développement durable de l'économie québécoise et canadienne, la Chaire tente de mieux comprendre l'écologie, l'évolution et la biodiversité ainsi que ses impacts sur la santé et la croissance des arbres. Ses recherches permettent de prévoir les interactions entre la biodiversité végétale et les écosystèmes au Québec et de proposer des avenues pour améliorer les pratiques en gestion forestière.

Mes activités de recherche actuelles incluent l'utilisation de séquençage ADN de haut débit pour comprendre la diversité et l'assemblage des communautés microbiennes et l'écologie évolutive des plantes et des bactéries dans les forêts tempérées et tropicales. Bien que j'utilise beaucoup de méthodes quantitatives et la bioinformatique dans mes recherches, je suis également un biologiste de terrain; j’ai en effet effectué des recherches dans les écosystèmes forestiers et appliqué la théorie écologique à la gestion durable des forêts boréales.

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PUBLICATIONS
Livres



Chapitres de livre



Livres et actes de colloques publiés à titre d'éditeur



Articles publiés dans des revues avec comité de lecture


  1. Pavoine, S., Marcon, E., Ricotta, C. and Kembel, S.W. (2016) 'Equivalent numbers' for species, phylogenetic or functional diversity in a nested hierarchy of multiple scales. Methods in Ecology and Evolution, 7(10):1152-1163. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Pennell, M.W., FitzJohn, R.G., Cornwell, W.K. and Kembel, S.W. (2016) A simple approach for maximizing the overlap of phylogenetic and comparative data. Methods in Ecology and Evolution, 7(6):751-758. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Laforest-Lapointe, I., Messier, C. and Kembel, S.W. (2016) Host species identity, site and time drive temperate tree phyllosphere bacterial community structure. Microbiome, 4. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Laforest-Lapointe, I., Messier, C. and Kembel, S.W. (2016) Tree phyllosphere bacterial communities: Exploring the magnitude of intra- and inter-individual variation among host species. PeerJ, 2016(8). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Morlon, H., O'Connor, T.K., Bryant, J.A., Charkoudian, L.K., Docherty, K.M., Jones, E., Kembel, S.W., Green, J.L. and Bohannan, B.J.M. (2015) The biogeography of putative microbial antibiotic production. PLoS ONE, 10(6). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. Siefert, A., Violle, C., Chalmandrier, L., Albert, C.H., Taudiere, A., Fajardo, A., Aarssen, L.W., Baraloto, C., Carlucci, M.B., Cianciaruso, M.V., de L. Dantas, V., de Bello, F., Duarte, L.D.S., Fonseca, C.R., Freschet, G.T., Gaucherand, S., Gross, N., Hikosaka, K., Jackson, B., Jung, V., Kamiyama, C., Katabuchi, M., Kembel, S.W., Kichenin, E., Kraft, N.J.B., Lagerstrom, A., Bagousse-Pinguet, Y.L., Li, Y., Mason, N., Messier, J., Nakashizuka, T., Overton, J.M., Peltzer, D.A., Prerez-Ramos, I.M., Pillar, V.D., Prentice, H.C., Richardson, S., Sasaki, T., Schamp, B.S., Schob, C., Shipley, B., Sundqvist, M., Sykes, M.T., Vandewalle, M. and Wardle, D.A. (2015) A global meta-analysis of the relative extent of intraspecific trait variation in plant communities. Ecology Letters, 18(12):1406-1419. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. O'Dwyer, J.P., Kembel, S.W., Sharpton, T.J. and Pacala, S.W. (2015) Backbones of evolutionary history test biodiversity theory for microbes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(27):8356-8361. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. O'Dwyer, J.P., Kembel, S.W. and Sharpton, T.J. (2015) Erratum: Backbones of evolutionary history test biodiversity theory for microbes (Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (2015) 112 (8356-8361)). Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112(47):E6589. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Martin, L.J., Adams, R.I., Bateman, A., Bik, H.M., Hawks, J., Hird, S.M., Hughes, D., Kembel, S.W., Kinney, K., Kolokotronis, S.-O., Levy, G., McClain, C., Meadow, J.F., Medina, R.F., Mhuireach, G., Moreau, C.S., Munshi-South, J., Nichols, L.M., Palmer, C., Popova, L., Schal, C., Taubel, M., Trautwein, M., Ugalde, J.A. and Dunn, R.R. (2015) Evolution of the indoor biome. Trends in Ecology and Evolution, 30(4):223-232. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  13. Meadow, J.F., Altrichter, A.E., Kembel, S.W., Kline, J., Mhuireach, G., Moriyama, M., Northcutt, D., O'Connor, T.K., Womack, A.M., Brown, G.Z., Green, J.L. and Bohannan, B.J.M. (2014) Indoor airborne bacterial communities are influenced by ventilation, occupancy, and outdoor air source. Indoor Air, 24(1):41-48. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. Joly, S., Davies, T.J., Archambault, A., Bruneau, A., Derry, A., Kembel, S.W., Peres-Neto, P., Vamosi, J. and Wheeler, T.A. (2014) Ecology in the age of DNA barcoding: The resource, the promise and the challenges ahead. Molecular Ecology Resources, 14(2):221-232. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  21. Baldeck, C.A., Kembel, S.W., Harms, K.E., Yavitt, J.B., John, R., Turner, B.L., Chuyong, G.B., Kenfack, D., Thomas, D.W., Madawala, S., Gunatilleke, N., Gunatilleke, S., Bunyavejchewin, S., Kiratiprayoon, S., Yaacob, A., Nur Supardi, M.N., Valencia, R., Navarrete, H., Davies, S.J., Hubbell, S.P. and Dalling, J.W. (2013) A taxonomic comparison of local habitat niches of tropical trees. Oecologia, 173(4):1491-1498. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  23. Burge, D.O., Jui, G., Kembel, S.W. and Zhukovsky, K. (2012) Microsatellite markers from Ceanothus roderickii (Rhamnaceae) using next-generation sequencing technology. American Journal of Botany, 99(3):e127-e130. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  24. Kembel, S.W., Wu, M., Eisen, J.A. and Green, J.L. (2012) Incorporating 16S Gene Copy Number Information Improves Estimates of Microbial Diversity and Abundance. PLoS Computational Biology, 8(10):-. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  25. Craine, J.M., Wolkovich, E.M., Gene Towne, E. and Kembel, S.W. (2012) Flowering phenology as a functional trait in a tallgrass prairie. New Phytologist, 193(3):673-682. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  29. Craine, J.M., Nippert, J.B., Towne, E.G., Tucker, S., Kembel, S.W., Skibbe, A. and McLauchlan, K.K. (2011) Functional consequences of climate change-induced plant species loss in a tallgrass prairie. Oecologia, 165(4):1109-1117. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  30. Sharpton, T.J., Riesenfeld, S.J., Kembel, S.W., Ladau, J., O'Dwyer, J.P., Green, J.L., Eisen, J.A. and Pollard, K.S. (2011) PhyLOTU: A high-throughput procedure quantifies microbial community diversity and resolves novel taxa from metagenomic data. PLoS Computational Biology, 7(1):e1001061. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  31. Sargent, R.D., Kembel, S.W., Emery, N.C., Forrestel, E.J. and Ackerly, D.D. (2011) Effect of local community phylogenetic structure on pollen limitation in an obligately insect-pollinated plant. American Journal of Botany, 98(2):283-289. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  34. Klepac-Ceraj, V., Lemon, K.P., Martin, T.R., Allgaier, M., Kembel, S.W., Knapp, A.A., Lory, S., Brodie, E.L., Lynch, S.V., Bohannan, B.J.M., Green, J.L., Maurer, B.A. and Kolter, R. (2010) Relationship between cystic fibrosis respiratory tract bacterial communities and age, genotype, antibiotics and Pseudomonas aeruginosa. Environmental Microbiology, 12(5):1293-1303. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  35. Cadotte, M.W., Jonathan Davies, T., Regetz, J., Kembel, S.W., Cleland, E. and Oakley, T.H. (2010) Phylogenetic diversity metrics for ecological communities: Integrating species richness, abundance and evolutionary history. Ecology Letters, 13(1):96-105. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  36. Kembel, S.W., Cowan, P.D., Helmus, M.R., Cornwell, W.K., Morlon, H., Ackerly, D.D., Blomberg, S.P. and Webb, C.O. (2010) Picante: R tools for integrating phylogenies and ecology. Bioinformatics, 26(11):1463-1464. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  39. Sachs, J.L., Kembel, S.W., Lau, A.H. and Simms, E.L. (2009) In situ phylogenetic structure and diversity of wild Bradyrhizobium communities. Applied and Environmental Microbiology, 75(14):4727-4735. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  41. Lamb, E.G., Kembel, S.W. and Cahill Jr., J.F. (2009) Shoot, but not root, competition reduces community diversity in experimental mesocosms. Journal of Ecology, 97(1):155-163. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
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  47. Cousens, R.D., Dale, M.R.T., Taylor, J., Law, R., Moerkerk, M. and Kembel, S.W. (2006) Causes of pattern in plant communities where environmental change is rapid and species longevity is short. Journal of Vegetation Science, 17(5):599-614. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  48. Kembel, S.W. and Dale, M.R.T. (2006) Within-stand spatial structure and relation of boreal canopy and understorey vegetation. Journal of Vegetation Science, 17(6):783-790. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  49. Kembel, S.W. and Hubbell, S.P. (2006) The phylogenetic structure of a neotropical forest tree community. Ecology, 87(7 Suppl):S86-S99. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  50. Kembel, S.W. and Cahill Jr, J.F. (2005) Plant phenotypic plasticity belowground: A phylogenetic perspective on root foraging trade-offs. American Naturalist, 166(2):216-230. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  51. Cahill Jr., J.F., Kembel, S.W. and Gustafson, D.J. (2005) Differential genetic influences on competitive effect and response in Arabidopsis thaliana. Journal of Ecology, 93(5):958-967. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  52. Waters, I., Kembel, S.W., Gingras, J.-F. and Shay, J.M. (2004) Short-term effects of cut-to-length versus full-tree harvesting on conifer regeneration in jack pine, mixedwood, and black spruce forests in Manitoba. Canadian Journal of Forest Research, 34(9):1938-1945. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Articles publiés dans des actes de colloque (proceedings)


  1. Mhuireach, G., Bohannan, B., Brown, G.Z., Green, J.L., Jones, E., Kembel, S.W., Kline, J., Northcutt, D., Stenson, J. and Womack, A.M. (2012) The relationship between ventilation energy use and indoor microbial communities. In 10th International Conference on Healthy Buildings 2012. Pages 563-564. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Rapports scientifiques, manuels et autres



Thèses, mémoires et essais


  1. Kembel, S.W. (2007) Leaf and root functional traits, phylogeny, and the structure of plant populations and communities. Thèse de doctorat, University of Alberta. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Kembel, S.W. (2001) Small-scale spatial patterns of boreal mixedwood forest vegetation. Mémoire de maîtrise, University of Alberta. (EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Thèses, mémoires et essais supervisés



Articles publiés dans des revues sans comité de lecture



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********************************************************** ***************** Colloque du CEF ************************ **********************************************************

1 et 2 mai 2017
Coeur des sciences de l'UQAM

********************************************************** ***************** Mycorhizes 2017 **************************** **********************************************************

10-11 mai | Université Laval

********************************************************** ***************** R à Québec **************************** **********************************************************

25-26 mai | Université Laval

********************************************************** ***************** Formation CEF **************************** **********************************************************

CEF-Formation

Introduction à GGPlot2
13 avril 2017 à l'UQAM | 20 avril 2017 à l'UQAT

********************************************************** ***************** Cours du CEF **************************** **********************************************************

Cours du CEF

Analyse des pistes et modélisation par équations structurelles pour écologistes 
1–5 mai 2017 | Université de Sherbrooke
Path analysis and structural equation modelling for ecologists 
May 1–5 2017 | Université de Sherbrooke
8e Semaine de Dendroécologie de la FERLD 
16–21 mai 2017 | FERLD
Cours d'été: Terrain avancé en environnement (GÉO 6041) 
Cours aux cycles supérieurs de 3 crédits offert par François Girard, du 2 au 7 juillet 2017 à la Forêt Montmorency non loin de Québec.
Cours d’été en statistiques bayésiennes – Summer school in Bayesian statistics 
École d’été en statistiques bayésiennes. Maximum de 20 participants.
14 au 18 août | Orford Musique (à 30 minutes de Sherbrooke)
Aménagement des écosystèmes forestiers (ENV7010) 
14 au 25 août 2017, FERLD, Abitibi
Cours sur la complexité 
24-29 septembre 2017, Toscane, Italie

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...Une exposition
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CEF-Référence
La référence vedette !

Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

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