© Christian Leduc

Jonathan Cazabonne

Doctorant
Mycologie forestière|Écologie et aménagement des écosystèmes forestiers
Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue

Institut de Recherche sur les Forêts (IRF)
Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue (UQAT)
445, boul. de l'Université
Rouyn-Noranda (Québec) Canada J9X 5E4

Directeur: Maxence Martin
Codirecteur: Mélanie Roy 

Editor of Sydowia Fungal Systematic and Evolution (FUSE) series 

Co-editor of BMS Fungal Ecology Special Issue "Fungal conservation: from knowledge to actions" 

Pour en savoir plus sur mes travaux : ResearchGate  | ORCID  | Bluesky  | LinkedIn  | TeamLaboul  | Réécrire la forêt boréale  | Mycosphaera 

We are unthinkable without fungi, yet seldom do we think about them. It is an ignorance we can’t afford to sustain.

FaunaFloraFunga (FFF) initiative’s statement (also in Year in review 2022, FFF initiative)

Titulaire d'une licence en biologie des organismes, des populations et des écosystèmes, ainsi que d'une maîtrise de recherche en écologie et aménagement des écosystèmes forestiers, mes recherches visent à apporter une connaissance plus fine de la diversité (morphologique et génétique) des champignons et de leurs intéractions avec d'autres règnes, avec un focus tout particulier sur les symbioses ectomycorhiziennes et les intéractions champignons-arthropodes. J'aborde ces thématiques à travers de multiples prismes, notamment ceux de l'écologie moléculaire, de l'écologie des communautés, de la taxonomie intégrative, des sciences citoyennes, ainsi que de la littérature et de l'art. Les buts ultimes de mes recherches sont de (1) contribuer à l'intégration des champignons dans les plans de conservation de la diversité biologique et de gestion durable et écosystémique des forêts, et (2) sensibiliser le grand public aux enjeux clés qu'incarnent les champignons.

Je suis actuellement étudiant en thèse à l'Institut de recherche sur les forêts, rattaché à l'Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue. Dans ce cadre, j'étudie la diversité fongique dans les sols des vieilles forêts boréales de l'est du Canada, ainsi que leurs fonctions écologiques, et j'explore de nouveaux outils afin de faciliter le suivi de la diversité fongique des sols dans le cadre de l'aménagement forestier écosystémique. Je suis également membre de la #TeamLaboul, un groupe de recherche basé à Ghent (Belgique) et České Budějovice (République tchèque), où j'étudie la diversité des Laboulbeniomycetes, un groupe de champignons strictement associés aux arthropodes, ainsi que la conservation des champignons. Je suis également membre d’un groupe de recherche intersectoriel entre l'Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue et l’Université du Québec à Montréal, « Réécrire la forêt boréale », où j'exploite le potentiel littéraire de la recherche scientifique sur les champignons.

Résumé en anglais de mon projet de thèse

Because of current forest management practices, areas of old-growth boreal forests are declining in eastern Canada and represent major conservation challenges. These stands exhibit a complex and typically heterogeneous spatial structure and host a unique diversity of species, habitats and ecological functions. Most of this diversity is found in the soil and is dominated by ectomycorrhizal fungi, for which boreal forests are reputed as a biodiversity hotspot. Ectomycorrhizal and saprotrophic fungi are both indispensable to the functioning of old-growth forests, particularly as key players in the forest carbon cycle. However, significant gaps remain regarding soil fungal diversity in such habitats, especially concerning underexplored relationships between soil fungal communities and two typical characteristics of old-growth boreal forest stands: spatial heterogeneity and carbon storage. Additionally, current knowledge about soil fungal diversity—primarily described using environmental DNA—remains difficult for foresters to apply in the field and is limited in old-growth boreal forests due to their isolation and the extensive areas they can cover. However, recent tools that describe—at different spatial scales—forest composition and structural complexity have emerged to facilitate forest biodiversity mapping and monitoring, such as the Potential Biodiversity Index and airborne Light Detection and Ranging. Still, their predictive potential toward soil fungal diversity remains largely underexplored, notably in North America. Using a unique network of old-growth boreal forests in north-western Quebec, we aim to explain local fungal spatial heterogeneity and explore how the diversity of soil fungal communities interacts with the forest carbon cycle and indicators of aboveground forest structures. For chapter I, soil fungal environmental DNA and physiochemical properties were obtained in eleven plots along a 264-old fire chronosequence in 2018 to characterize belowground fungal diversity and spatial heterogeneity. Measures of aboveground habitat heterogeneity will complement the existing data to test the link between soil fungal communities, habitat heterogeneity, forest maturity and tree dominance. For chapter II, within the same chronosequence, aboveground and belowground carbon stocks will be measured to test the association with ectomycorrhizal and saprotrophic communities and their metabolic activity described by eRNA. For chapter III, an airborne LiDAR inventory was conducted covering the chronosequence in 2017 and PBI measurements will be applied to a set of newly established old-growth forest plots to test the correlations with soil fungal diversity described by eDNA. This thesis will provide a novel perspective on the internal richness of old-growth boreal forests and essential tools to incorporate soil funga into ecosystem-based forest management plans in Canada.

FORMATION

  • Candidat au doctorat (Ph.D.) en écologie et aménagement des écosystèmes forestiers, Université du Québec en Abitibi Témiscamingue, Institut de recherche sur les forêts, Rouyn-Noranda, Québec, Canada. Thèse: Diversité et rôles écologiques des communautés fongiques du sol des vieilles forêts boréales de l'est du Canada : perspectives pour la conservation de la fonge forestière. Supervision : Maxence Martin  et Mélanie Roy (2024-présent)
  • Maîtrise de recherche (M.Sc.) en écologie et aménagement des écosystèmes forestiers, Université du Québec en Abitibi Témiscamingue, Institut de recherche sur les forêts, Amos, Québec, Canada. Mémoire de recherche: Influence de la zonation verticale sur les communautés fongiques du sol des pinèdes grises naturelles dans les écosystèmes d'esker . Supervision : Miguel Montoro Girona  et Annie Desrochers  (2022-2024)
  • Licence (B.Sc.) en Biologie - Sciences de la Vie, Biologie des Organismes, Populations et Ecosystèmes (BOPE), spécialité Physiologie, diversité et systématique des plantes; co-inscription en Classes préparatoires aux grandes écoles (CPGE), BCPST (Biologie, Chimie, Physique et Sciences de la Terre) au Lycée Général et Technologique Agricole de Toulouse-Auzeville. Université Paul Sabatier, Toulouse (2018-2021)

En réalité nous sommes démesurés. Nous faisons parti des rares espèces qui aient franchi la taille […] du millimètre.

Marc-André Selosse, Journée nationale des sols vivants. Le sol, la vie du sol et l'Homme, 3 aout 2018 - Marciac

THÉMATIQUES DE RECHERCHE

1. Taxonomie intégrative
Je suis intimement convaincu que l'on ne peut pas étudier l'écologie et l'évolution des systèmes vivants sans savoir nommer ou comprendre la diversité biologique qui s'y trouve. La base fondamentale de mes travaux de recherche est donc l'étude et la compréhension de la diversité des champignons, en incluant toutes leurs singularités par rapport aux autres êtres vivants. Je m'intéresse tout particulièrement à la taxonomie et à la systématique des champignons, c'est à dire la circonscription des espèces en se basant sur le plus grand nombre de caractères discriminants possibles, comme ceux aux niveaux morphologiques, physiologiques, écologiques et moléculaires, et l'étude des liens de parentés entre les organismes. L'intégration de ces différentes techniques qui allient à la fois le descriptif et l'analytique permettent d'avoir une idée de quels organismes sont présents dans l'environnement ainsi que les processus évolutifs de mise en place de cette diversité dans le temps et l'espace.

2. Écologie des communautés d'organismes
L'étape suivante de mon travail est d'étudier les mécanismes et facteurs environnementaux (biotiques et abiotiques) d'assemblage des communautés fongiques. Ces recherches permettent d'avoir une idée qualitative et quantitative de pourquoi telles espèces et communautés sont présentes à tel endroit et à tel instant. Pour arriver à ces fins, je tire profit entre autre des nouvelles technologiques de séquençage à haut débit sur l'ADN des champignons microscopiques présents dans les sols forestiers.

“Fungi? Why should I care about fungi? If I save the plants and animals, won’t the fungi be fine as well?” Actually, it’s very likely the real truth is the other way around. Saving the fungi should be considered critical to saving the animals and the plants. We routinely say that, in nature, everything is connected. We forget to mention however, that the connection is most often fungal.

~George Christie in a 2024 EG News (Rhode Island)

3. Conservation de la fonge
L'ensemble de mes recherches ont pour perspective commune d'accumuler des connaissances fondamentales sur la diversité et les communautés de champignons afin de mieux les intégrer et les prendre en compte dans les programmes de conservation et d'aménagement des écosystèmes. Je mets un point d'honneur à baser mes investigations à la fois à l'échelle des espèces et des communautés de champignons. Les enjeux de conservation de la diversité biologique vont bien au delà de l'unique conservation des espèces. La véritable emphase de la conservation se trouve au niveau de la protection et conservation des réseaux d'interactions dans lesquels les espèces sont impliquées.

Dans cette perspective globale, je tente de contribuer à mon échelle à la reconnaissance de tous les champignons comme règne à part entier supportant la majorité des formes de vie sur Terre. De part leur omniprésence dans l'ensemble des écosystèmes et les rôles fondamentaux qu'ils jouent, les champignons sont une porte d'entrée, encore pas assez explorée, pour la conservation des écosystèmes dans leur globalité.


Critères de développement durable des forêts selon le Conseil canadien des ministres des forêts, en 1995.
Crédit: Jonathan Cazabonne

Implications pour l'aménagement durable des forêts
La conservation de la diversité des êtres vivants est devenue l’un des objectifs les plus importants de l’aménagement durable des forêts. Grâce aux nouvelles techniques de détection de l’ADN des organismes dans l’environnement, on redécouvre les territoires forestiers sous un nouveau jour. Les forêts sont en réalité le théâtre de nombreuses et diverses interactions entre organismes qu’on ne peut percevoir à l’œil nu. L’essentiel du fonctionnement des forêts se passe dans l’invisible et est gouverné par les champignons. Ces derniers sont partout et jouent des rôles fondamentaux au sein des écosystèmes terrestres. Ce constat pose la question de leur intégration, encore inachevée, dans les plans de conservation et d’aménagement durable des écosystèmes forestiers.

En effet, les champignons se retrouvent au cœur des enjeux et critères de l’aménagement forestier durable et représentent un potentiel encore peu exploré pour maintenir l’intégrité des forêts dans l’espace et dans le temps. Ces organismes sont une porte d’entrée de choix afin de conserver la diversité biologique des forêts, puisque protéger tous les champignons induirait la protection de l’ensemble de l’écosystème. De futures recherches sont nécessaire afin d’identifier les écarts en composition, en dynamique et en fonctions liées aux champignons entre les forêts naturelles et aménagées.

Ignorer les champignons dans les politiques d’aménagement forestiers revient à ignorer les organismes qui sont à l’origine même de ces écosystèmes. Il serait dans ce cas justifié de remettre en question le caractère réellement "durable" d'un tel aménagement.


Nuage de mots caractérisant mes recherches et mes centres d'intérêts

Mes autres intérêts connexes
En marge de mes activités principales de recherche, je m'intéresse également (i) à bâtir des liens entre les sciences et l'art et la littérature, (ii) aux relations et usages des champignons par l'espèce humaine (ethnomycologie), (iii) à l'influence des facteurs anthropiques (anthropocentrisme et anthropomorphisme) sur notre perception et considération des champignons, (iv) l'histoire des sciences (épistémologie) de l'évolution et (v) aux principes et enjeux fondamentaux de la taxonomie, de la nomenclature et de l'étude de la diversité biologique, comme par exemple les questions autour de l'éponymie, de la nomination des singletons et des espèces de champignons connues seulement via leur ADN ("dark" fungi), l'importance des checklists d'espèces et les sciences citoyennes.


Thallus mature de Laboulbenia quarantena De Kesel & Haelew. Echelle: 450-500 µm de long. Modifié de Haelewaters & De Kesel (2020)

Depuis quelques années, ma curiosité a été suscité par un groupe de champignons qui se trouve être à la parfaite frontière entre tous mes centre d'intérêts et de recherche: les Laboulbeniales. Il s'agit de champignons ectoparasites obligatoires d'arthropodes, que ce soit pour leur dispersion ou en tant qu'épibiontes. Ils ne ressemblent en rien à l'image que l'on se fait des champignons, même ceux microscopiques. Ils ne sont pas filamenteux et sont plutôt formés d'un ensemble de cellules structurées en trois dimensions formant ce qu'on appelle un thallus. La première espèces de ce groupe a été décrite il y a deux siècles et plus de la moitié de ces espèces actuellement connues ont été décrites par une seule personne, Roland Thaxter. On connait 2,459 espèces (réparties en 145 genres) de Laboulbeniales, alors que l'on estime un nombre total d'espèces plus de 15 fois supérieur à ce qu'on connait déjà. Ce système hôte-parasite est un cas d'école de groupe de champignons méconnus où tout reste à découvrir. Cette association est aussi un modèle d'interaction de choix pour étudier des problématiques liées à la taxonomie, l'écologie des communautés et la conservation biologique.

L'importance de la communication et de l'éducation à la mycologie
Les champignons nous sont cachés (entre autres) en raison de nos habitudes et traditions, nos sens, notre culture, notre sémantique, mais aussi en raison de la structure, de la taille ou bien de la biologie même de ces organismes. Un exemple frappant est notre vision des champignons généralement restreinte à une seule saison et un seul type d’écosystème (l’automne et les forêts), alors que les champignons sont présents partout et en toute saison - conséquence d’habitudes et traditions souvent ancrées depuis le plus jeune âge.

Les principales causes de cette vision des champignons "filtrées" sont l'anthropocentrisme (c'est à dire voir les champignons sous l'unique perspective de l'Homme, ce dernier se plaçant comme élément central et universel de toutes les considérations et vérités) et l'anthropomorphisme (c'est à dire de reconnaitre ou d'attribuer des caractéristiques propres à l'Homme sur des entités vivantes ou inertes qui ne sont pas l'Homme). Cela a des conséquences sur la place des champignons dans les politiques environementales, l'économie, l'éducation et le quotidien, avec l'un des moteurs entretenant à la fois les causes et ses conséquences: la communication et le sens que l'on donne aux mots que l'on communique (la sémantique). Il existe donc une réelle nécéssité d'inverser cette tendance. Cette inversion demeure néanmoins difficle puisque les champignons sont en dissonance avec les idées préconçues de notre sociétés (reproduction sexuée, critères de "beauté", agriculture, et cetera).

Les facteurs anthropiques ont leur place dans notre perception et nos considérations des champignons, car en partie ils nous définissent, mais ces derniers ne doivent toutefois pas être le principal et unique moteur du développement de la mycologie.

Si vous voulez vraiment savoir ce que l'intelligence est à la plante, et bien essayez les branchies de l'Homme. Vous verez à quel point il y a des utilisations de termes venus d'une autre discipline, qui sont certe de belles métaphores, mais qui ne sont pas libérateurs.

Marc-André Selosse, entretien pour le Colloque JNE plantes : quand l'intelligence cache la plante (27 février 2020)

PUBLICATION

Publications scientifiques révisées par un comité scientifique

  1. Cazabonne J., De Wint F.C., Hughes M., Martin T.E., Pan J.Y. and Haelewaters D. (2026). La-Bools, Mysterious Fungi that Deserve Your Attention. Front. Young Minds. 14:1606219. doi: 10.3389/frym.2026.1606219
  2. Cazabonne J., de Groot, M.D., Haelewaters, D. (2026). Hidden in plain sight: iNaturalist observations of Harmonia axyridis reveal new records of its fungal ectoparasite Hesperomyces harmoniae in Québec, Canada. Northeastern Naturalist 33(2): 141–159. https://www.eaglehill.us/NENAonline/articles/NENA-33-2/10-Cazabonne.shtml
  3. Cazabonne J., Haelewaters D., Acar I, Alhomaidi E., Al Tami M.S., Aman N., Iliushin V.A., Aslam A., Bhatt L.R., Majeed M.B.B., Poudel R.C., Chaudhary S., Digra S., Dovana F., Dufosssé L., Ferisin G., Ghafoor A., Hanif S., Ijaz H., Ishaq A., Jabeen S., Karabiyik H., Khalid A.N., Kirtsideli I., Kiran M., Khadka D., Mallik A., Madrid H., Moncalvo J.-M., Scott N., Niazi A.R., Nonzom S., O Íková H., Umar A., Ullah S., Usman M. & Krisai-Greilhuber I. (2025) Fungal ystematics and Evolution: FUSE 11. – Sydowia 77: 315–383.
  4. Crous, P.W. et al. (2025). Fungal Planet description sheets: 1781–1866. Persoonia - Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi. https://doi.org/10.3114/persoonia.2025.54.10
  5. Thiyagaraja V., Hyde K.D., Piepenbring M., Davydov E.A. et al. (2025). Orders of Ascomycota. Mycosphere 16(1), 536–1411. https://www.mycosphere.org/pdf/MYCOSPHERE_16_1_8-1.pdf
  6. Cazabonne, J. & Haelewaters, D. (2024). ‘Invisible and uncharismatic’ fungi need taxonomy champions, too.  Nature communications, 635(39)
  7. Hyde KD, Noorabadi MT, Thiyagaraja V. et al. (2024). The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa. Mycosphere 15(1), 5146–6239, https://doi.org/10.5943/mycosphere/15/1/25
  8. Wijayawardene, N.N., Hyde, K.D., Mikhailov, K.V. et al. (2024). Classes and phyla of the kingdom Fungi.  Fungal Diversity, https://doi.org/10.1007/s13225-024-00540-z
  9. Jiménez-Mejías, P., Manzano, S., Gowda, V., Krell, F.T., Lin, M.Y., Martín-Bravo, S., Martín-Torrijos, L., Nieto Feliner, G., Mosyakin, S.L., Naczi, R.F.C., Acedo, C., Álvarez, I., Crisci, J.V., Luceño Garcés, M., Manning, J., Moreno Saiz, J.C., Muasya, A.M., Riina, R., Sánchez Meseguer, A., Sánchez-Mata, D. and 1543 additional coauthors (2024). Protecting stable biological nomenclatural systems enables universal communication: A collective international appeal. BioScience, biae043.
  10. Haelewaters, D., Quandt, C. A., Bartrop, L., Cazabonne, J., Crockatt, M. E., Cunha, S. P., ... & Gonçalves, S. C. (2024). The power of citizen science to advance fungal conservation. Conservation Letters, e13013. https://doi.org/10.1111/conl.13013
  11. Cazabonne, J., Walker, A. K., Lesven, J., & Haelewaters, D. (2024). Singleton-based species names and fungal rarity: Does the number really matter?. IMA fungus, 15(1), 7. https://doi.org/10.1186/s43008-023-00137-2
  12. Hyde KD, Abdollahzadeh J., Abeywickrama P.D., Absalan S., Afshari N. et al. Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa. Mycosphere, 14(1): 1960–2012. https://doi.org/10.5943/mycosphere/14/1/23
  13. Haelewaters D., Matthews T.J., Wayman J.P., Cazabonne J., Heyman F., Quandt A., Martin T.E. Biological knowledge shortfalls impede conservation efforts in poorly studied taxa – a case study of Laboulbeniomycetes. Journal of Biogeography, 1-11. https://doi.org/10.1111/jbi.14725.
  14. Lesven, J. A., Druguet Dayras, M., Cazabonne, J., Gillet, F., Arsenault, A., Rius, D., & Bergeron, Y. (2024). Future impacts of climate change on black spruce growth and mortality: review and challenges.  Environmental Reviews. 32(2): 214-230
  15. Cazabonne J. 2023. The Use of Humans Senses in the Identification of Mushrooms III – taste.  Field Mycology, 24 (1): 29 – 31.
  16. Cazabonne J. 2022. The Use of Humans Senses in the Identification of Mushrooms II - touch.  Field Mycology, 23 (4): 118 – 122.
  17. Cazabonne J. & Ferrières M. 2022. Leucopaxillus tricolor (Agaricales,Tricholomataceae) : Une Première Récolte pour l’Aveyron.  Bulletin mycologique et botanique Dauphiné Savoie, 245: 41 – 54.
  18. Cazabonne J., Bartrop L., Dierickx G., Gafforov Y., Hofmann T. A., Martin T. E., Piepenbring M., Rivas-Ferreiro M. & Haelewaters D. 2022. Molecular-based Diversity Studies and Field Surveys Are Not Mutually Exclusive: On The Importance of Integrated Methodologies in Mycological Research.  Frontiers in Fungal Biology, 3: 860777. http://dx.doi.org/10.3389/ffunb.2022.860777 
  19. Cazabonne J., Cochard H., Gryta H. & Jargeat P. 2021. Une Nouvelle Récolte du Rare Mycena chlorinosma (Agaricales, Mycenaceae) en France.  Bulletin de la société mycologique de France, 137 (1-4): 85 – 99.
  20. Cazabonne J. 2021. The Use of Humans Senses in the Identification of Mushrooms.  Field Mycology, 22 (4): 117 – 122. https://doi.org/10.1016/j.fldmyc.2021.10.005 
  21. Cazabonne J., Ferrières M. & Menos J.L. 2021. A First Contribution to the Knowledge of Mycetozoa from Aveyron (France).  Carnets Natures, 8: 67 – 81.

Chapitre de livre

  1. De Wint FC, Cazabonne J., Koid QQ, Lee Ai Lan M, Shahbaz M, Fayle TM, Seelan JSS. 2026. History, challenges, and opportunities in the study of entomopathogenic fungi in tropical regions: Borneo as a model ecosystem. EcoEvoRxiv, https://doi.org/10.32942/X2HH4Z.
  2. Cazabonne J., Haelewaters D, Blondelle A, Ingala de Waal M. 2026. Towards integrating interaction networks into global parasite conservation: insights from bats, bat flies and their fungal associates. EcoEvoRxiv, https://doi.org/10.32942/X2N677.
  3. Cazabonne, J., Martin, T. E., Matthews, T. J., Quandt, C. A., Wayman, J. P., Haelewaters, D. Knowledge gaps explored for Laboulbeniomycetes, a clade of understudied microfungi, including a new shortfall related to a lack of taxonomic expertise. Authorea (preprint). https://doi.org/10.22541/au.173956895.54632274/v1
  4. Gafforov Y., İnci Ş., Rašeta M., Cazabonne J., Semra S.E., Yarasheva M., Rapior S. (2023) Mor-chella esculenta (L.) Pers.; Morchella steppicola Zerova - MORCHELLACEAE. In: Ethnobiology of Uzbekistan: Ethnomedicinal Knowledge of Mountain Communities. (Khojima-tov, O.K., Gafforov, Y., Bussmann, R.W. (eds) Cham, Springer International Publishing, pages 1285-1308. https://doi.org/10.1007/978-3-031-23031-8_119

Thèses et rapports

  1. Rocheleau-Duplain, M., Guay, F., Doyon, É., Lebeuf, R., Langlois, A., Bois, M., Sigouin, G., Fortier, D. & Cazabonne, J. (2026). Inventaire de biodiversité fongique de la Forêt de la Seigneurie de Lotbinière. Mycosphaera. p. 135
  2. Rocheleau-Duplain, M., Guay, F., Doyon, Fortier, D. & Cazabonne, J. (2025). Inventaire de biodiversité fongique du Lac Therrien. Mycosphaera, 107
  3. Cazabonne, J. (2024). Influence du type de sol et de la zonation verticale sur les communautés fongiques dans les pinèdes grises naturelles des écosystèmes d'eskers. (Mémoire de maîtrise). Université du Québec en Abitibi-Témiscamingue. https://depositum.uqat.ca/id/eprint/1592

Articles de bulletins scientifiques

  1. Cazabonne, J., Stallman, J.K., Huber, H., Adamson, E., Grigoriev, I.V., Rocheleau-Duplain, M., Mueller, G. (2026). Report on the congress “Fungal Conservation in Europe: Evidence to Action” in Uppsala, Sweden, April 2026. Inoculum, June 2026. https://msafungi.org/wp-content/uploads/2026/07/Inoculum-June-2026-v.-3.pdf
  2. Cazabonne, J., Jerry, M-È., Chambon, L., & Martin, M. (2024). The unexplored research potential of tree-related microhabitats in North America. The Canadian Botanical Association Bulletin, 57(3): 14-20. https://www.cba-abc.ca/wp-content/uploads/2024/12/CBA-Bulletin_573-1.pdf

Oeuvres litéraires

  1. Cazabonne, J. (2025). Et si nous étions eux. In: Eskers. Hope, J., Bérard, C., Cyr, C., & Montoro Girona, M. (Eds). Publications Zinc, numéro 67. https://revuezinc.com/numero-67/
  2. Cazabonne, J. (2024). La maison de Berry. In: Boréaliser. Hope, J., Bérard, C., Cyr, C., & Montoro Girona, M. (Eds). Publications Zinc, numéro 64. https://revuezinc.com/numero-64/

Publications vulgarisées non révisées par un comité scientifique

  1. Cazabonne J. Été 2026. La conservation des champignons en chiffres. Couvert boréal, 23 (3): 39-40.
  2. Cazabonne J. Été 2025. Au-delà de nos assiettes : pourquoi les champignons sont-ils bien plus qu'une histoire de comestiblité. Couvert boréal, 22 (3): 38-39.
  3. Cazabonne J. Été 2023. Les champignons au coeur de l'aménagement forestier durable. Couvert boréale, 19 (3): 19-20. 
  4. Cazabonne J. Printemps 2023. Que sont véritablement les champignons forestiers?. Couvert boréale, 19 (2): 13-14. 
  5. Cazabonne J. Hiver 2023. Quel devenir pour les feuilles en hiver?. Couvert boréale, 19 (1): 15. 
  6. Cazabonne J., Girona M. M. & DesRochers A. Printemps 2022. La diversité fongique cachée des forêts d’esker d’Abitibi. Couvert Boréal, 18 (2): 12. 

Lettres et articles dans la presse

  1. Cazabonne, J. et 18 cosignataires. (2026). Au secours des champignons. Le Devoir. https://www.ledevoir.com/opinion/idees/986645/secours-champignons?
  2. David Roy et 32 co-signataire. Biodiversité : sans suivi ni trajectoire claire, comment atteindre nos cibles 2030 ?. Le Journal de Montréal, https://www.journaldemontreal.com/2026/05/22/biodiversite-sans-suivi-ni-trajectoire-claire-comment-atteindre-nos-cibles-2030
  3. Cazabonne, J. & Haelewaters, D. (2025). Fungi are among the planet’s most important organisms — yet they’re overlooked in conservation strategies. The Conversation Canada, https://theconversation.com/fungi-are-among-the-planets-most-important-organisms-yet-theyre-overlooked-in-conservation-strategies-250483
  4. Cazabonne, J. et 73 cosignataires. (2024). Le Québec doit aussi miser sur les champignons pour préserver sa biodiversité. Le Devoir. https://www.ledevoir.com/opinion/idees/823837/idees-quebec-doit-aussi-miser-champignons-preserver-biodiversite?

CONFÉRENCES, COMMUNICATION ET VULGARISATION SCIENTIFIQUE

Présentations scientifiques. *présentateur

  1. Conférencier invité : Cazabonne J.*. Fungal conservation in Canada and Québec : current state, challenges and ongoing efforts to move it forward. Online webinar, Ontario Land Trust Alliance Inc. 15 July 2026.
  2. Entrevue publique, concours Force Avenir Sélection 2026, catégorie Environement. Mycosphaera : premier OBNL dédié à la conservation des champignons au Canada. https://webdiffusion.forcesavenir.com/candidats/mycosphaera/
  3. Conférencier invité : Rocheleau-Duplain*, M., Cazabonne, J. La science citoyenne et les enjeux de la conservation de la fonge au Québec et au Canada, replacer les champignons au cœur des débats sur la biodiversité. Salon de la Forêt, Université Laval. 21 mars 2026.
  4. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Conservation de la fonge : État actuel, enjeux et opportunités futures. Cours donné au Cégep de Sainte-Foy. 18 mars 2026.
  5. Conférencier invité : Cazabonne J.*, Roy M., Martin M. Fonctions écologiques et services écosystémiques rendus par les champignons au sein des territoires forestiers boréaux dans un contexte de gestion durable des forêts. Master en bioéthique et responsabilité, Université de Toulouse. 9 mars 2026.
  6. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Fungal conservation in Canada: Current state, challenges and ongoing efforts to move it forward. Webinaire organisé par le projet paneuropéen Biodiversa+ FunDive. 24 février 2026. Enregistrement en ligne.
  7. Conférencier invité : Cazabonne, J.*, Rocheleau-Duplain*, M. Faune, flore et fonge : quelle place pour les champignons en conservation au Canada et au Québec ? Midi de la conservation, Réseau de milieux naturels protégés. Enregistrement en ligne.
  8. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Faire avancer la conservation de la fonge au Québec grâce à la science citoyenne. 49ème congrès de l’Association des biologistes du Québec. Sherbrooke, Québec, 21 novembre 2025.
  9. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Le règne oublié : La fonge comme socle de la conservation. Panel de discussion, Pavillon du Canada. Congrès mondial sur la nature de l’UICN, Abu Dhabi, Émirats arabes unis, 10 octobre 2025.
  10. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Advancing fungal conservation through citizen science and transdisciplinarity: the example of Mycopshaera. 5th CanFunNet annual symposium, en ligne, 7 août 2025.
  11. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Conservation de la fonge à l’international et au Québec : bilan, enjeux, défis, solutions et perspectives futures. Conférence pour les membres de la FQGM. Juin 2025, en ligne, 26 Juin 2025.
  12. Conférencier : Cazabonne, J*., Roy, M., Martin, M. Intégrer les champignons du sol des vieilles forêts boréales mixtes et les services écosystémiques qu'ils fournissent dans la gestion durable des forêts. Poster, 26ème colloque de la chair AFD. 20 novembre 2024, Val d’Or, Québec, Canada.
  13. Participants : Haelewaters D.*, Matthews T.J., Wayman J.P., Cazabonne J., Heyman F., Quandt A., Martin T.E. Biological knowledge shortfalls of arthropod-associated Laboulbeniomycetes as a case study for poorly studied taxa. XI Congreso latinoamericano de micologia. Asociación Latinoamericana de Micología. Panamá, 7-10 Août 2023.
  14. Participants : Gaboriau D.M.*, Lesven J., Magne G., Cazabonne J., Olivier M., Chavardes R.D., Girona M.M., Martin M., Bergeron Y. 2023. Facteurs clés de la diversité écologique et biologique des 36 îles du lac Hébécourt, QC, Canada. Poster, 3ème rencontre annuelle de l’IRN Cold Forest. Station touristique Duchesnay, Québec, 3 et 5 octobre 2023.
  15. Participants : Haelewaters D.*, Matthews T.J., Wayman J.P., Cazabonne J., Heyman F., Martin T.E, Quandt A. Biological knowledge shortfalls of Laboulbeniomycetes as a case study for poorly studied taxa. Poster, rencontre annuelle de la Mycological Society of America (MSA), “Elevating Mycology”. Flagstaff, Arizona, 30 Juillet – 3 Août, 2023.
  16. Conférencier invité : Cazabonne, J*. Champignons des eskers : aménagement et conservation. Rencontre annuelle de la FQGM, Trécesson, Québec, Canada.
  17. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Écologie et caractérisation de l’habitat des macro-champignons ectomycorhiziens comestibles dans les peuplements de Pinus banksiana de l’Est du Canada. Seconde rencontre annuelle du GREMA, Amos, Québec, Canada.
  18. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Les champignons des forêts d’esker : sur l’origine de la distribution spatiale des communautés fongiques. Première rencontre annuelle du GREMA, Amos, Québec, Canada.
  19. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Soil fungal communities in Esker forests. Poster, 15ème conférence annuelle du CEF.
  20. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Unravelling the Unique Fungal Diversity Hidden in Podzol from Abitibi Esker Forests. Poster, North American Forest Ecology Workshop (NAFEW), Gather Town, section Wildlife/Biodiversity.
  21. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Niches Partitioning of Soil Fungal Communities in Esker Forests. Poster, conférence annuelle de l’ABC. 6-10 Juin 2022, Rouyn-Noranda, Québec, Canada.
  22. Conférencier invité : Cazabonne, J.* Les champignons des forêts d’esker : une aventure mycologique québécoise. Pôle n°3 – conférences, Les Dryades. En ligne, 9 février 2022.
  23. Conférencier : Cazabonne, J.* Describing Fungi: Morphological or Molecular Data, Which One to Choose? GRE-MIDIS, 27 Janvier 2022, Amos, Québec, Canada.
  24. Conférencier invité : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. Unravelling for the first time the fungal diversity of northern Quebec Esker forests. Seminar series du CanFunNet. En ligne, 20 Janvier 2022.
  25. Conférencier invité : Cazabonne J.*, Cochard H., Gryta H. & Jargeat, P. Découverte d’un champignon rare dans le bois de Pouciquot : Mycena chlorinosma Singer. Journal club de l’association Veracruz. En ligne, 13 Janvier 2022.
  26. Conférencier : Cazabonne, J.*, DesRochers, A., Girona, M.M. A la découverte des champignons mystérieux des Forêts d'Esker : une folie mycologique ? 23e colloque de la Chaire AFD. En ligne, 21 décembre 2021.

https://www.youtube.com/watch?v=d3NM5ozC8ao

https://www.youtube.com/watch?v=R_TxlQQp77s

//https://www.youtube.com/watch?v=ztB4bPomm6k

https://www.youtube.com/watch?v=bKEeViEI8g0

Interviews et présence dans les médias

  1. Interview radio : Chroniqueur scientifique pour l'émission Moteur de recherche Peut-on cartographier les champignons? , avec Matthieu Dugal. Mardi 30 juin 2026.
  2. Interview radio : Quelles sont les recherches sur l’usage des champignons?. Moteur de recherche, avec Matthieu Dugal. 1er Juin 2026. https://ici.radio-canada.ca/ohdio/premiere/emissions/moteur-de-recherche/segments/rattrapage/2389921/quelles-sont-recherches-sur-usage-champignons
  3. Podcast : « Épisode #17 : Le rocambolesque défi de la conservation des champignons », podcast Nébulosa, avec Florent Morency. 8 décembre 2025.
  4. Podcast : « S01E09-Mycologie et écosystèmes forestiers », podcast Écologie & Sociétés, avec Patrick Truong. 10 novembre 2025.
  5. Interview- article écrit : Prix de la conservation volontaire. Prix de l’initiative de l’année - Mycosphaera. Magazine Nature sauvage, numéro 70 – Hiver 2025-2026, p. 26-27.
  6. Interview radio : Experts say Quebec needs to protect its vulnerable mushroom species. Breakaway with Alison Brunette, CBC.
  7. Interview radio : Could mushrooms become protected by law? Let’s go with Sabrina Marandola, CBC.
  8. Interview radio : Pourquoi faut-il mieux protéger les champignons? Des matins en or, Radio-Canada. 14 octobre 2025.
  9. Interview radio – presse écrite : Des experts voudraient que le Québec protège mieux les champignons. Radio-Canada. 10 octobre 2025.
  10. Interview radio : “Sans les champignons, «notre planète aurait un visage complètement différent», explique un mycologue”, QUB Radio 99.5 avec Isabelle Perron.
  11. Interview radio : “Voici comment savoir si un champignon est toxique !”, QUB Radio 99.5 avec Isabelle Perron.
  12. Interview radio : “Quebec scientist aims to raise awareness about endangered fungi”, All in a Weekend avec Sonali Karnick. https://www.cbc.ca/listen/live-radio/1-78-all-in-a-weekend/clip/16136963-quebec-scientist-aims-raise-awareness-endangered-fungi
  13. MSA student spotlight : mise en lumière de mon parcours étudiant, Student and Postdoc Section. Newsletter d’octobre 2024. https://msastudents.org/category/newsletter/
  14. Interview - Ambassadeur : “Étudier à l’UQAT”, produite par l’IRF pour le Couvert Boréal journal.
  15. Podcast radio : “Démystifier les champignons avec Jonathan Cazabonne”, Épisode #18 de l’émission Pose ta science. https://www.mixcloud.com/CampusFM/pts-18/
  16. Conférence grand public : “Démystifier les champignons : au-delà de nos préjugés sur la mycologie”, organisé par les associations Veracruz et Les Dryades, Université Paul Sabatier. https://www.youtube.com/watch?v=bKEeViEI8g0
  17. Interview radio : « Réécrire la forêt boréale : l’UQAM et l’UQAT se rencontrent », émission Ça vaut le retour avec Vanessa Limage, Radio-Canada. 11 novembre 2022. https://ici.radio-canada.ca/ohdio/premiere/emissions/ca-vaut-le-retour/episodes/667573/rattrapage-du-vendredi-11-novembre-2022
  18. Interview radio : “Rencontre entre la littérature et l’écologie forestière”, émission Ça vaut le retour avec Vanessa Limage, Radio-Canada. 4 mai 2022. https://ici.radio-canada.ca/ohdio/premiere/emissions/ca-vaut-le-retour/episodes/625542/rattrapage-du-mercredi-4-mai-2022
  19. Figurant court métrage : Figurant dans la bande vidéo promotionnelle de l’UQAT, services audiovisuels. https://www.youtube.com/watch?v=dYDEERqJiDU
  20. Interview – article écrit: “Early career mycologist”, publiée dans le bulletin de l’ABC, septembre 2022, par Allison Walker et Mélissande Nagati.
  21. Interview télévision : “Premier colloque du GRÉMA : une réussite”, sur MédiAT. https://www.youtube.com/watch?v=k149yK3_Y2s&t=388s
  22. Interview télévision : “Champignons : le vrai du faux”, sur France 3 Télévision – Occitanie. https://x.com/jonathan_czb/status/1457466991019712517

https://www.youtube.com/embed/1jAETNS8mT0?si=7r-LMt7xJEAqt6op

https://www.youtube.com/embed/4Dyy-nYaqz0?si=7DohIuaPTxOjqKEc

https://www.youtube.com/watch?v=dYDEERqJiDU

Lectures publiques

  1. Réécrire la forêt boréale : lectures publiques le 10 novembre 2022 au Café-In de l’UQAT à Amos et le 11 novembre 2022 au Bar-Librairie Livresse à Rouyn-Noranda.

Ceux qui se ressemblent ne sont pas les mêmes et les mêmes ne se ressemblent pas. […] Les champignons sont si fugaces, si polymorphes, qu’avec eux nous devons nous contenter de connaître nos incertitudes.

Georges Becker (1974)

MES RECOMMENDATIONS...

... de lecture

Voici une sélection non-exhaustive des lectures qui m'ont marquées. J'estime certaines de ces lectures comme des incontournables pour toute personne s'intéressant de près ou de loin aux domaines de l'écologie et de l'évolution. Vous y trouverez également quelques lectures personnelles (liste par ordre chronologique et alphabétique):

  • Pas de forêt sans champignons, par Hubert Voiry (Acte Sud, 2022)
  • The Hidden Kingdom of Fungi: Exploring the Microscopic World in Our Forests, Homes, and Bodies, par Keith Seifert (Greystone Books, 2022)
  • A l'aube de la 6ème extinction: comment habiter la Terre, par Bruno David (Grasset, 2021)
  • Entangled life: How Fungi Make Our Worlds, Change Our Minds & Shape Our Futures, par Merlin Sheldrake (Random House, 2021)
  • L'origine du monde: Une histoire naturelle du sol à l'intention de ceux qui le piétinent, par Marc-André Selosse (Actes Sud, 2021).
  • Encabanée, par Gabrielle Filteau-Chiba (XYZ, 2020)
  • Sous la forêt : Pour survive il faut des alliés, par Francis Martin (HumenSciences, 2019)
  • Jamais Seul, par Marc-André Selosse (Actes Sud, 2016). Chez la même maison d'édition et par le même auteur, en 2019, vous pouvez retrouver Les Goûts et les couleurs du monde: Une histoire naturelle des tannins, de l'écologie à la santé.
  • L'Evolution, Questions d'Actualités?, par Guillaume Lecointre (Coédition Quaé – Muséum national d’Histoire naturelle, 2014)
  • Guide Critique de l'Evolution, par Corinne Fortin, Gérard Guillot, Marie-Laure Le Louarn-Bonnet, Alain Bénéteau, et Thomas Haessig, sous la direction de Guillaume Lecointre (Editions Belin, 2009)
  • Classification Phylogénétique du Vivant, par Guillaume Lecointre et Le Guyader Hervé (Belin, 2001). Je vous recommande particulièrement la quatrième édition du tome 1 (2016) et 2 (2017) qui intègrent des discussions autour des microorganismes et l'implication des outils moléculaires.
  • The Extended Phenotype: The Long Reach of the Gene, par Richard Dawkins (Oxford University Press, 1982). Une seconde édition a été publiée en 2016.
  • The Selfish Genes, par Richard Dawkins (Oxford University Press, 1976). Une seconde, troisième et quatrième édition ont été publiée en 1989, 2006 et 2016, respectivement.
  • Contributions to the Theory of Natural Selection. Une série d'essais par Alfred Russel Wallace. (London: Macmillan and Co., 1870)
  • On the Origin of Species by Means of Natural Selection or the Preservation of Favoured Races in the Struggle for Life, par Charles Darwin (John Murray, 1859)

********************************************************** *************************** FRQNT ************************ **********************************************************

********************************************************** *********************** Infolettre *********************** **********************************************************

Abonnez-vous à
l'Infolettre du CEF!

Colloque annuel CEF 2026

********************************************************** ************** Formations et Écoles d'été **************** **********************************************************

Formations et Écoles

École d’été en modélisation de la biodiversité 2026 
24 au 28 août 2026
Cours donné par Dominique Gravel, au Centre de villégiature Jouveance (Orford, QC)
Date limite d'inscription : 15 juin 2026

********************************************************** ********* Mémoire CEF Changements Climatiques ************ **********************************************************

************************************************************* ***************** Pub - Atlas Biodiversité ****************** *************************************************************

********************************************************** ***************** Pub - Symphonies_Boreales ****************** **********************************************************