François Rousseu

Professionnel de recherche
Statistiques et programmation R


Bureau D5-209
Université de Sherbrooke
2500, boulevard de l'Université
Sherbrooke, QC, J1K 2R1

Bur :(819) 821-8000 #63917
Cell: (418) 999-2784


GitHub: https://github.com/frousseu 

FORMATION
  • M.Sc. Écologie, Influence de la structure du paysage sur la territorialité du Colibri à gorge rubis, 2010 (Université de Sherbrooke)
  • B.Sc. Biologie, 2007 (Université du Québec à Rimouski)
  • Techniques d'écologie appliquée, 2005 (Cégep de Sherbrooke)
PRÉSENTATION

Au cours de ma maîtrise dans le labo de Marc Bélisle, j'ai développé un fort intérêt pour tout ce qui touche à l'analyse de données et à la programmation avec R. Les millions de lignes de données générées par les visites des colibris aux abreuvoirs m'ont forcé à apprendre R afin de faciliter le traitement de données et l'automatisation des tâches. Depuis ce temps, mon principal intérêt en tant que biologiste est de relever les défis associés à l'analyse quantitative de données écologiques. Comment pourrait-on analyser ce jeu de données? Comment représenter numériquement telle variable? Pourrais-je programmer ceci afin d'automatiser cette tâche? Comment illustrer ces résultats? Voilà des questions que je trouve stimulantes.

Ayant débuté mes études en biologie en raison d'une passion pour les oiseaux, depuis le début de ma maîtrise j'ai surtout travaillé en lien avec la faune aviaire comme contractuel pour le Service canadien de la faune (SCF). J'ai notamment travaillé sur la sélection d'habitat par l'Oie des neiges, les densités d'oiseaux pélagiques par échantillonnage par distance (distance sampling), la phénologie de nidification des oiseaux au Canada  (Outil de requête des calendriers de nidification ) et la réalisation d'outils interactifs spatiaux (R et Shiny) en lien avec les urgences environnementales. Au cours de ces travaux, j'ai également travaillé sur divers packages R (rNest ,GeoAviR, ECSASconnect), utilisé Shiny , GitHub , LaTeX , etc. et j'ai réalisé la très grande majorité de mes tâches spatiales avec R. Même si la plupart de mes expériences sont avec les oiseaux, je suis bien évidemment ouvert à travailler sur n'importe quel projet touchant de près ou de loin à l'écologie!

En bref, n'hésitez pas à me contacter si vous avez des questions en lien avec:

  • Les statistiques et l'analyse de données (simulations, méthodes Monte Carlo, modélisation, etc.)
  • Le traitement de données (lecture de fichiers txt, mise en forme de base données, calculs de valeurs compliquées, etc.)
  • Programmation R et création de package
  • Les tâches spatiales avec R
  • Production de graphiques complexes (ou pas)
  • Production de rapports automatisés (knitr , markdown , LaTeX )
  • Création d'application Shiny 
EXEMPLES
PUBLICATIONS ET COMMUNICATIONS

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1er au 3 mai 2019
UQAC

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********************************************************** ************* Écoles d'été et formation **************************** **********************************************************

Écoles d'été et formations

Cours intensif sur l'analyse des pistes 
6-10 mai 2019, Université de Sherbrooke
Cours intensif : Taxonomie et méthodes d’échantillonnage en tourbières 
6-17 mai 2019, Université Laval
Dendrochronological Fieldweek 2019 
16-21 mai 2019, Station FERLD
Traits Fonctionnels des Organismes - École thématique internationale
19-24 mai 2019, Porquerolles, France
Cours aux cycles supérieurs: Terrain avancé en géographie 
10-15 juin 2019, FERLD, Abitibi-Témiscamingue
École d'été « Drones et télédétection environnementale » 
13-14 juin 2019, Sherbrooke
Ecole d'été en Biologie et Ecologie intégratives 
6-12 juillet 2019, Pyrénées françaises
École d'été en modélisation de la biodiversité 
19-23 août 2019, Orford
Cours aux cycles supérieurs: Aménagement des écosystèmes forestiers 
19-30 août 2019, Station FERLD

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CEF-Référence
La référence vedette !

Jérémie Alluard (2016) Les statistiques au moments de la rédaction 

  • Ce document a pour but de guider les étudiants à intégrer de manière appropriée une analyse statistique dans leur rapport de recherche.

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