Isabelle Laforest-Lapointe

Membre régulière
Impact des interactions plante-microorganismes de la phyllosphère sur les fonctions des écosystèmes terrestres

Impact of plant-microbe interactions in the phyllosphere on terrestrial ecosystem functions

Professeure adjointe
Université de Sherbrooke
Faculté des Sciences
Département de biologie
2500, boul. de l'Université
Sherbrooke (Québec) J1K 2R1
Canada

(819) 821-8000 Poste 63473

Formation | CRC | Publications

FORMATION
  • Post-Doctoral Research Position - Departments of Physiology and Pharmacology & Pediatrics, Cumming School of Medicine, University of Calgary (2017 - 2019) - Directrice: Marie-Claire Arrieta 
  • Ph.D Biology - Université du Québec à Montréal (2012 - 2017) - Directeur: Steven Kembel  - Co-Directeur: Christian Messier
  • M.Sc Statistics & Operations Research  - Universitat Politecnica de Catalunya (2011 - 2012)
  • M.Sc Terrestrial Ecology & Biodiversity Management - Universitat Autonoma de Barcelona (2011) - Directeur: Javier Retana  - Co-Directeur: Jordi Martinez-Vilalta 
  • B.Sc Biology (Environment & Conservation) - Université Laval (2010)
BIOGRAPHIE
THÈMES DE RECHERCHE

Titulaire de la Chaire de recherche du Canada en écologie microbienne appliquée

Chaire de Recherche du Canada Niveau 2 / Canada Research Chair Tier 2

L'écologie microbienne, une synergie entre la microbiologie, l'écologie et la bioinformatique, a révélé un rôle important des interactions hôte-microorganismes en tant que moteurs des fonctions des écosystèmes terrestres telles que la productivité et la résilience. L'objectif de ma CRC est d'explorer les interactions hôte-microbes multi-trophiques dans un contexte de (1) variation temporelle de la structure taxonomique et fonctionnelle des communautés microbiennes ; (2) augmentation des stress abiotiques dus au changement global ; et (3) développement de technologies de bio-contrôle microbien (communautés synthétiques) comme alternative aux produits chimiques. Cette CRC en écologie microbienne appliquée permettra à la fois d'élargir notre compréhension mécanistique des symbioses plantes-microbes et d'améliorer les technologies visant à maintenir la productivité et la résilience des écosystèmes terrestres.

Microbial ecology, a synergy between microbiology, ecology, and bioinformatics, has revealed an important role for host-microbe interactions as drivers of terrestrial ecosystem functions such as productivity and resilience. The objective of the CRC is to explore multi-domain host-microbe interactions in a context of (1) temporal variation of taxonomic and functional microbial community structure; (2) increasing abiotic stresses due to global change; and (3) development of microbial bio-control technologies (synthetic communities) as an alternative to chemicals. The CRC in Applied Microbial Ecology will both expand our mechanistic understanding of plant- microbe symbioses and improve technologies aimed at maintaining ecosystem productivity and resilience.

PRIX ET DISTINCTIONS
  • 2018/12 - Best post-doctoral presentation, Snyder Institute
  • 2018/01 - Top 10 Scientific Discoveries from Quebec of 2017, Quebec Science
  • 2017/05 - PhD Diversity and Excellence in Research Award, Canadian Society of Ecology and Evolution
  • 2017/04 - Research Award for best student publication, Université du Québec à Montréal
  • 2015/07 - ISME Best Contribution, 5th Phyllosphere International Symposia, International Society of Microbial Ecology
Personnel

Directions d'étudiants

Maîtrises
Joey Chamard
Sarah Ishak

Codirections


Ancien personnel

Étudiants diplômés
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PUBLICATIONS
Livres



Chapitres de livre



Livres et actes de colloques publiés à titre d'éditeur



Articles publiés dans des revues avec comité de lecture


  1. Klancic, T., Laforest-Lapointe, I., Wong, J., Choo, A., Nettleton, J.E., Chleilat, F., Arrieta, M.-C., Reimer, R.A. (2021) Concurrent prebiotic intake reverses insulin resistance induced by early-life pulsed antibiotic in rats. Biomedicines, 9(1):1-24. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  2. Laforest-Lapointe, I., Becker, A.B., Mandhane, P.J., Turvey, S.E., Moraes, T.J., Sears, M.R., Subbarao, P., Sycuro, L.K., Azad, M.B., Arrieta, M.-C. (2021) Maternal consumption of artificially sweetened beverages during pregnancy is associated with infant gut microbiota and metabolic modifications and increased infant body mass index. Gut Microbes, 13(1):1-15. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  3. Mahdavi, M., Laforest-Lapointe, I., Massé, E. (2021) Preventing colorectal cancer through prebiotics. Microorganisms, 9(6). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  4. Heirali, A., Thornton, C., Acosta, N., Somayaji, R., Laforest-Lapointe, I., Storey, D., Rabin, H., Waddell, B., Rossi, L., Arrieta, M.C. et al. (2020) Sputum microbiota in adults with CF associates with response to inhaled tobramycin. Thorax, 75(12):1058-1064. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  5. Klancic, T., Laforest-Lapointe, I., Choo, A., Nettleton, J.E., Chleilat, F., Noye Tuplin, E.W., Alukic, E., Cho, N.A., Nicolucci, A.C., Arrieta, M.-C. et al. (2020) Prebiotic Oligofructose Prevents Antibiotic-Induced Obesity Risk and Improves Metabolic and Gut Microbiota Profiles in Rat Dams and Offspring. Molecular Nutrition and Food Research, 64(16). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  6. van Tilburg Bernardes, E., Pettersen, V.K., Gutierrez, M.W., Laforest-Lapointe, I., Jendzjowsky, N.G., Cavin, J.-B., Vicentini, F.A., Keenan, C.M., Ramay, H.R., Samara, J. et al. (2020) Intestinal fungi are causally implicated in microbiome assembly and immune development in mice. Nature Communications, 11(1). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  7. Laforest-Lapointe, I., Whitaker, B.K. (2019) Decrypting the phyllosphere microbiota: progress and challenges. American Journal of Botany, 106(2):171-173. (Scopus  | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  8. Heirali, A.A., Acosta, N., Storey, D.G., Workentine, M.L., Somayaji, R., Laforest-Lapointe, I., Leung, W., Quon, B.S., Berthiaume, Y., Rabin, H.R. et al. (2019) The effects of cycled inhaled aztreonam on the cystic fibrosis (CF) lung microbiome. Journal of Cystic Fibrosis, 18(6):829-837. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  9. Ximénez-García, C., Finlay, B.B., Nieves-Ramírez, M.E., Partida-Rodríguez, O., Laforest-Lapointe, I., Reynolds, L.A., Brown, E.M., Valdez-Salazar, A., Morán-Silva, P., Rojas-Velázquez, L. et al. (2018) Asymptomatic intestinal colonization with protist Blastocystis is strongly associated with distinct microbiome ecological patterns. mSystems, 3(3). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  10. Laforest-Lapointe, I., Arrietaa, M.-C. (2018) Microbial eukaryotes: A missing link in gut microbiome studies. mSystems, 3(2). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  11. Wallace, J., Laforest-Lapointe, I., Kembel, S.W. (2018) Variation in the leaf and root microbiome of sugar maple (Acer saccharum) at an elevational range limit. PeerJ, 2018(8). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  12. Ruiz-González, C., Archambault, E., Laforest-Lapointe, I., Del Giorgio, P.A., Kembel, S.W., Messier, C., Nock, C.A., Beisner, B.E. (2018) Soils associated to different tree communities do not elicit predictable responses in lake bacterial community structure and function. FEMS microbiology ecology, 94(8). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  13. Laforest-Lapointe, I., Paquette, A., Messier, C., Kembel, S.W. (2017) Leaf bacterial diversity mediates plant diversity and ecosystem function relationships. Nature, 546(7656):145-147. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  14. St-Denis, A., Kneeshaw, D.D., Belanger, N., Simard, S., Laforest-Lapointe, I., Messier, C. (2017) Species-specific responses to forest soil inoculum in planted trees in an abandoned agricultural field. Applied Soil Ecology, 112:1-10. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  15. Laforest-Lapointe, I., Arrieta, M.-C. (2017) Patterns of early-life gut microbial colonization during human immune development: An ecological perspective. Frontiers in Immunology, 8(JUL). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  16. Laforest-Lapointe, I., Messier, C., Kembel, S.W. (2017) Tree leaf bacterial community structure and diversity differ along a gradient of urban intensity. mSystems, 2(6). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  17. Laforest-Lapointe, I., Messier, C., Kembel, S.W. (2016) Host species identity, site and time drive temperate tree phyllosphere bacterial community structure. Microbiome, 4. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  18. Laforest-Lapointe, I., Messier, C., Kembel, S.W. (2016) Tree phyllosphere bacterial communities: Exploring the magnitude of intra- and inter-individual variation among host species. PeerJ, 2016(8). (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  19. Wallace, J., Aquilue, N., Archambault, C., Carpentier, S., Francoeur, X., Greffard, M.-H., Laforest-Lapointe, I., Galicia, L., Messier, C. (2015) Present forest management structures and policies in temperate forests of Mexico: Challenges and prospects for unique tree species assemblages. Forestry Chronicle, 91(3):306-317. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )
  20. Laforest-Lapointe, I., Martínez-Vilalta, J., Retana, J. (2014) Intraspecific variability in functional traits matters: Case study of Scots pine. Oecologia, 175(4):1337-1348. (Scopus  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Articles publiés dans des actes de colloque (proceedings)



Rapports scientifiques, manuels et autres



Thèses, mémoires et essais


  1. Laforest-Lapointe, I. (2017) Exploring the temperate tree leaf microbiome : from natural forests to controlled experiments and urban environments. Thèse de doctorat, UQAM. (URL  | Résumé | EndNote | BibTeX-CSV | BibTeX | Scholar )


Thèses, mémoires et essais supervisés



Articles publiés dans des revues sans comité de lecture



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