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Mike Flannigan est membre associé au CEF. Il est employé par le Service Canadien des Forêts à Sault-Ste-Marie en Ontario et étudie l'intercation entre les changements climatiques et les feux de forêts.
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Programmation de recherche

Nous envisageons nos activités à l’interface d’une gamme de disciplines de recherche, allant de l’organisme au paysage et d’applications de recherche, allant de l’amélioration génétique à l’étude d’un zonage fonctionnel pour la forêt. Nous visons à développer une synergie novatrice et inclusive entre ces 2 grands vecteurs de recherche dans le secteur forestier de façon à réaliser notre mission scientifique et sociale. De plus, l’implication d’un grand nombre de chercheurs du CEF aux niveaux national et international, et d’un certain nombre d’entre eux en milieu tropical et sub-tropical, nous assure un rayonnement international. Nous proposons quatre axes de recherche intégrateurs, dont chacun est animé par un responsable reconnu comme un chef de file dans le domaine qui a pour mandat d'intégrer les projets et encourager le développement de nouvelles équipes. Ces axes se structurent autour de six Chaires, de projets d’équipe de grande ampleur (une vingtaine), du Programme Canadien du Carbone  (Margolis, U. Laval), du Réseau de gestion durable des forêts  (RGDF, un Réseau de centres d'excellence Canadien), du Réseau Ligniculture Québec  (RLQ), du projet Arborea  (MacKay & Bousquet, U. Laval), du Consortium Ifor , de projets stratégiques du CRSNG, de projets en partenariat de recherche du CRSNG, et de projets de recherche en équipe du FQRNT.

AXE I. Génétique, biologie moléculaire et physiologie (Responsable: J. Bousquet)

L'intensification de la sylviculture préconisée dans certaines régions pour compenser les pertes de bois provenant des aires protégées et de l’aménagement écosystémique (principe de la TRIADE) nécessite une connaissance approfondie de la croissance, du développement, de la physiologie ainsi que de l’adaptation d'organismes-clés (espèces commerciales, leurs symbiotes et leurs pathogènes). Cet axe regroupe des équipes qui se penchent sur la génétique et la physiologie des arbres afin de fournir les bases essentielles à l’atteinte d’une productivité accrue des forêts et à la conservation des ressources. De plus, la chaire de recherche du Canada en génomique forestière et environnementale  (Bousquet, U. Laval) contribue activement au développement de cet axe.

A) Développer des méthodes d’analyse numérique et de nouveaux types de marqueurs moléculaires pour comprendre l’organisation et le fonctionnement des génomes ainsi que l’importance et l’évolution de leur diversité moléculaire aux plans spatial et temporel (Bernier, Bousquet, Tremblay). Ces recherches ont déjà une portée internationale en cartographie du génome d’essences résineuses, une étape essentielle à la sélection et l’amélioration génétique des essences commerciales.

B) Identifier des facteurs intrinsèques moléculaires (Laliberté, MacKay) et physiologiques (Berninger, Laliberté, Lapointe, Lechowicz, Margolis, Messier, MacKay, Shipley qui contrôlent la croissance des végétaux et des symbioses mycorhiziennes (Roy, Shipley, Piché). Ces recherches ont des ramifications évidentes pour les espèces commerciales mais aussi des débouchés prometteurs en milieu agroforestier (biorémédiation).

C) Maîtriser des techniques de micropropagation des essences forestières afin d’intensifier la foresterie clonale et de permettre des applications novatrices, notamment la production de phytomolécules (Laliberté, Lapointe, Tremblay).

D) Comprendre le flux génétique et la structure des populations de plantes et de leurs agents pathogènes et symbiotiques (Bernier, Bousquet, Dayanandan, Greene, Khasa, MacKay, Piché). Ces recherches revêtent une importance particulière dans le contexte de l'introduction croissante d'organismes sélectionnés et génétiquement modifiés dans les écosystèmes.

E) Raffiner les moyens de lutte contre les champignons pathogènes et les insectes ravageurs, en utilisant des approches moléculaires (Bernier) et physiologiques (Bauce, Mauffette).

AXE II. Dynamique des populations, biodiversité et biologie de la conservation (Responsable : J.-W. Shipley)

Une compréhension de la génétique et physiologie des organismes est nécessaire mais insuffisante à la compréhension de la répartition et de la performance (fitness – valeur sélective) des organismes forestiers, en raison de l'importance de facteurs populationnels, tels que la prédation, la dispersion et la compétition interspécifique. Cet axe regroupe des équipes s'intéressant aux aspects reliés à la dynamique des populations, de leurs interactions ainsi que des applications au niveau de l'aménagement forestier. De plus, la Chaire de recherche du Canada en biologie de la conservation (McIntire) et la chaire de recherche industrielle CRSNG en sylviculture et faune de la forêt boréale  (Pothier et, Fortin) sont associées au développement de cet axe.

A) Tendre vers une théorie de la sélection des habitats forestiers à différentes échelles spatiales chez les oiseaux et les mammifères (Bélisle, Desrochers (U. Laval), Despland, Drapeau, Fortin, Imbeau, Thomas). Ces recherches répondent à un besoin criant de généralisation, par le regroupement, d'approches et de jeux de données complémentaires.

B) Identifier des facteurs intrinsèques (différences individuelles, succès reproducteur, considérations bioénergétiques) qui contribuent à la compréhension et la prévision de l’impact des stress environnementaux sur la faune et la flore forestière (Bauce, Brisson, Despland, Gagnon, Greene, Messier, Lechowicz, Desrochers (U. Laval), Potvin, Roy, Shipley, Thomas).

C) Identifier les espèces les plus vulnérables aux différentes approches sylvicoles et évaluer leur utilité à titre d'indicateurs de biodiversité. Effet des coupes partielles et totales (Bauce, Bélanger, Bergeron, Bouchard, Buddle, Desrochers (U. Laval), Drapeau, Fortin, Imbeau, Messier, Lechowicz, Ruel, Work) sur les plantes, les oiseaux et les mammifères.

D) Comprendre les liens fonctionnels entre l’habitat et la biologie et le comportement des animaux et végétaux afin de développer des stratégies de conservation (Gagnon, Drapeau, Imbeau, Desrochers (U. Laval), Bauce, Bélanger, Despland).

AXE III. Fonctions de la forêt et développement de nouvelles approches sylvicoles (Responsable : C. Messier)

Cet axe considère les aspects théoriques et pratiques essentiels à une sylviculture visant des objectifs d’aménagement durable des forêts. Ces aspects concernent davantage les processus dynamiques et fonctionnels de l’écosystème forestier et en cela, agissent au-delà des aspects de la génétique, de la biologie des organismes et de leurs interactions. Le CEF est déjà un chef de file dans ce domaine mais compte élargir la portée de l'analyse de la dynamique à une plus grande diversité de milieux, comme la forêt feuillue et la forêt boréale de l'Est et même la forêt tropicale d’Amérique centrale. De plus, la Chaire de recherche du Canada en productivité forestière  (Berninger, UQAM) est activement associée au développement de cet axe.

A) Comprendre l'impact des pratiques forestières sur la biogéochimie des sols (Bradley, Brais, Fyles, Khasa, Munson, Piché) et considérer les aspects physico-chimiques et biologiques de la fertilité des sols (nutrition minérale, bactéries nitrificatrices, champignons symbiotiques).

B) Développer des indicateurs de qualité des sols, des eaux et du régime d'écoulement en fonction de différentes pratiques sylvicoles (Bradley, Brais, Côté, Fyles, Munson).

C) Comprendre l’influence des facteurs biotiques et abiotiques sur la régénération (stress post-plantation, remise en production, compétition, agroforesterie) (Bouchard, Bradley, Brais, Brisson, Greene, Khasa, Kneeshaw, Lechowicz, Margolis, Mauffette, Messier, Morin, Munson, Potvin, Ruel, Shipley).

D) Développer de nouvelles approches sylvicoles à l’échelle du peuplement (pratiques sylvicoles : Brais, Berninger, Kneeshaw, Messier, Munson, Pothier, Ruel) et à l’échelle du paysage (stratégies d’aménagement : Bauce, Bélanger, Bergeron, Drapeau, Greene, Kneeshaw, Messier, Morin, Raulier) basées sur notre connaissance de la dynamique naturelle des forêts.

E) Développer des approches de sylviculture intensive et de ligniculture (Bauce, Bernier, Bradley, Bouchard, Bousquet, Brais, Berninger, Buddle, DesRochers (UQAT), Fyles, Messier, Potvin, Tremblay).

AXE IV. Historique des perturbations naturelles et stratégies d’aménagement durable des forêts (Responsable : Y. Bergeron)

Cet axe porte sur le développement d’approches innovatrices qui visent à mettre en oeuvre l’aménagement durable des forêts. Il s’inscrit dans le contexte d’une planification globale de l’affectation du territoire forestier de manière à minimiser l’impact de la foresterie. La Chaire de recherche du Canada en écologie et en aménagement forestier durable  (Bergeron, UQAT), la Chaire de recherche du Canada en analyse quantitative des paysages (Cumming) et la Chaire industrielle CRSNG UQAT-UQAM en aménagement forestier durable  contribuent activement au développement de cet axe.. Les recherches reposent sur l’intégration de connaissances scientifiques de l’écologie et de la biologie forestière (voir les 3 premiers axes) et il s’articule plus spécifiquement autour des applications suivantes :

A) Étudier et comparer la dynamique naturelle des forêts des différentes régions du Canada (Bélanger, Bergeron, Bouchard, Kneeshaw, Parrott, Leduc, Messier, Morin, Munson, Pothier, Ruel).

B) Comprendre l'influence du climat sur les régimes de perturbations (Bauce, Bergeron, Kneeshaw, Leduc), sur le cycle du carbone d'écosystèmes forestiers et de tourbières (Fyles, Berninger, Margolis, Potvin) et prévoir la dynamique future de ces mêmes écosystèmes (Messier, Bergeron, Berninger, Margolis).

C) Développer des outils informatisés d’aide à la décision et de gestion permettant de mieux planifier nos scénarios d’aménagement à l’échelle du paysage et qui intègrent la conservation, l’aménagement intensif et l’aménagement extensif des territoires forestiers (Bergeron, Bouchard, Berninger, Cumming, Kneeshaw, Parrott, Margolis, Messier, Raulier, St-Onge).